Interactome of Ixr1, HMGB1 and HMGB2 proteins in relation to their cellular functions
- Barreiro Alonso, Aída
- María Esperanza Cerdán Co-director
- Mónica Lamas Co-director
Defence university: Universidade da Coruña
Fecha de defensa: 09 February 2018
- Angélica Figueroa Conde-Valvís Chair
- Inmaculada Vaca Cerezo Secretary
- Manuel Fuentes García Committee member
Type: Thesis
Abstract
La proteína de Saccharomyces cerevisiae Ixr1, y las proteínas humanas HMGB1 y HMGB2 se engloban dentro de la familia de proteínas HMGB. El principal objetivo de este trabajo ha sido la identificación de proteínas no previamente descritas que se unen a Ixr1, HMGB1 y HMGB2, para así poder ampliar el conocimiento sobre las funciones celulares de las proteínas HMGB. En levaduras, Ixr1 tiene un papel activador o represor de la transcripción sobre distintos promotores y controla la respuesta a hipoxia. El dominio de activación transcripcional de Ixr1 ha sido localizado en su extremo amino en este estudio. Ixr1 se une con Ssn8 y esta interacción puede mediar su papel represor sobre los promotores de algunos genes. Ixr1 además interacciona con proteínas relacionadas con el metabolismo de glucosa, estrés y biogénesis de ribosomas entre otras. Se ha detectado que Ixr1 presenta una fosforilación diferencial en función de la disponibilidad de oxígeno. Se ha llevado a cabo un estudio del interactoma de HMGB1 y HMGB2 mediante técnicas como el sistema de doble híbrido o purificaciones acopladas a espectrometría de masas en células epiteliales de ovario y próstata tumorales y no tumorales. Los resultados obtenidos ponen de manifiesto la amplia variedad de funciones asociadas a las proteínas que interactúan con HMGB1 o HMGB2. Se ha validado la interacción de HMGB1 con KRT7 y RBBP7 mediante otras técnicas complementarias. Así como también se han identificado interacciones específicas de HMGB1 en células tratadas con cisplatino.