Diseño y desarrollo de una plataforma bioinformática para la integración, gestión y visualización de redes de interacción de proteínas e interactomas

Abstract

El trabajo de investigación que se expone en esta tesis doctoral se centra en el ámbito de las interacciones entre proteínas y la definición global de los conjuntos de interacciones presentes en cada organismo, o interactomas, en forma de redes biomoleculares. Partiendo de las diferentes bases de datos públicas sobre interacciones entre proteínas se construye un sistema de integración de dichas interacciones y se generan interactomas con diferentes niveles de calidad en función del soporte experimental de las interacciones que contienen. Toda esta información se pone a disposición de la comunidad científica a través de una aplicación diseñada a tal efecto que, entre otras cosas, posibilita la visualización y anotación funcional de las redes de interacción generadas por el propio investigador. Dicha aplicación se ha denominado APID Interactomes y está libremente accesible en la URL http://apid.dep.usal.es.