Utilización de algoritmos de Global Testing para validar grupos de genes significativos asignables a respuestas clínicas
- Rivas Sanz, Javier de las
- Fontanillo Fontanillo, Celia
- Hernández Rivas, Jesús María
- Rivas López, María Jesús
- Rodríguez Vicente, Ana
- Sánchez Santos, José Manuel
Publisher: Universidad de Murcia. Departamento de Estadística e Investigación Operativa
ISBN: 978-84-691-8159-1
Year of publication: 2009
Congress: Congreso Nacional de Estadística e Investigación Operativa (31. 2009. Murcia)
Type: Conference paper
Abstract
Global Testing es un algoritmo estadstico para comprobar la asociacion de variables a un factor o condicion de respuesta en un conjunto de muestras. Se utiliza en estudios genomicos con microarrays para determinar si el per l de expresion genica de un grupo de genes esta signi cativamente asociado a un factor o condicion clnica de interes. Los grupos de genes, de cualquier tama~no, son elegidos a priori segun patrones, anotaciones o criterios conocidos. Se basa en modelos lineales generalizados que usan funciones enlace cuya eleccion depende de la naturaleza de la respuesta clnica objeto del estudio. En este trabajo presentamos un analisis de los parametros del algoritmo y lo aplicamos de modo concreto a un conjunto de datos de 31 microarrays de pacientes con Leucemia Linfatica Cronica (CLL) sobre varias condiciones clnicas de interes: metodo de procesamiento de la muestra, procedencia (medula osea o sangre periferica), perdida de parte del cromosoma 13, pronostico.