Perspectives on ENCODE

Abascal, F.; Acosta, R.; Addleman, N.J.; Adrian, J.; Afzal, V.; Aken, B.; Akiyama, J.A.; Jammal, O.A.; Amrhein, H.; Anderson, S.M.; Andrews, G.R.; Antoshechkin, I.; Ardlie, K.G.; Armstrong, J.; Astley, M.; Banerjee, B.; Barkal, A.A.; Barnes, I.H.A.; Barozzi, I.; Barrell, D.; Barson, G.; Bates, D.; Baymuradov, U.K.; Bazile, C.; Beer, M.A.; Beik, S.; Bender, M.A.; Bennett, R.; Bouvrette, L.P.B.; Bernstein, B.E.; Berry, A.; Bhaskar, A.; Bignell, A.; Blue, S.M.; Bodine, D.M.; Boix, C.; Boley, N.; Borrman, T.; Borsari, B.; Boyle, A.P.; Brandsmeier, L.A.; Breschi, A.; Bresnick, E.H.; Brooks, J.A.; Buckley, M.; Burge, C.B.; Byron, R.; Cahill, E.; Cai, L.; Cao, L.; Carty, M.; Castanon, R.G.; Castillo, A.; Chaib, H.; Chan, E.T.; Chee, D.R.; Chee, S.; Chen, H.; Chen, H.; Chen, J.-Y.; Chen, S.; Cherry, J.M.; Chhetri, S.B.; Choudhary, J.S.; Chrast, J.; Chung, D.; Clarke, D.; Cody, N.A.L.; Coppola, C.J.; Coursen, J.; D’Ippolito, A.M.; Dalton, S.; Danyko, C.; Davidson, C.; Davila-Velderrain, J.; Davis, C.A.; Dekker, J.; Deran, A.; DeSalvo, G.; Despacio-Reyes, G.; Dewey, C.N.; Dickel, D.E.; Diegel, M.; Diekhans, M.; Dileep, V.; Ding, B.; Djebali, S.; Dobin, A.; Dominguez, D.; Donaldson, S.; Drenkow, J.; Dreszer, T.R.; Drier, Y.; Duff, M.O.; Dunn, D.; Eastman, C.; Ecker, J.R.; Edwards, M.D.; El-Ali, N.; Elhajjajy, S.I.; Elkins, K.; Emili, A.; Epstein, C.B.; Evans, R.C.; Ezkurdia, I.; Fan, K.; Farnham, P.J.; Farrell, N.; Feingold, E.A.; Ferreira, A.-M.; Fisher-Aylor, K.; Fitzgerald, S.; Flicek, P.; Foo, C.S.; Fortier, K.; Frankish, A.; Freese, P.; Fu, S.; Fu, X.-D.; Fu, Y.; Fukuda-Yuzawa, Y.; Fulciniti, M.; Funnell, A.P.W.; Gabdank, I.; Galeev, T.; Gao, M.; Giron, C.G.; Garvin, T.H.; Gelboin-Burkhart, C.A.; Georgolopoulos, G.; Gerstein, M.B.; Giardine, B.M.; Gifford, D.K.; Gilbert, D.M.; Gilchrist, D.A.; Gillespie, S.; Gingeras, T.R.; Gong, P.; Gonzalez, A.; Gonzalez, J.M.; Good, P.; Goren, A.; Gorkin, D.U.; Graveley, B.R.; Gray, M.; Greenblatt, J.F.; Griffiths, E.; Groudine, M.T.; Grubert, F.; Gu, M.; Guigó, R.; Guo, H.; Guo, Y.; Guo, Y.; Gursoy, G.; Gutierrez-Arcelus, M.; Halow, J.; Hardison, R.C.; Hardy, M.; Hariharan, M.; Harmanci, A.; Harrington, A.; Harrow, J.L.; Hashimoto, T.B.; Hasz, R.D.; Hatan, M.; Haugen, E.; Hayes, J.E.; He, P.; He, Y.; Heidari, N.; Hendrickson, D.; Heuston, E.F.; Hilton, J.A.; Hitz, B.C.; Hochman, A.; Holgren, C.; Hou, L.; Hou, S.; Hsiao, Y.-H.E.; Hsu, S.; Huang, H.; Hubbard, T.J.; Huey, J.; Hughes, T.R.; Hunt, T.; Ibarrientos, S.; Issner, R.; Iwata, M.; Izuogu, O.; Jaakkola, T.; Jameel, N.; Jansen, C.; Jiang, L.; Jiang, P.; Johnson, A.; Johnson, R.; Jungreis, I.; Kadaba, M.; Kasowski, M.; Kasparian, M.; Kato, M.; Kaul, R.; Kawli, T.; Kay, M.; Keen, J.C.; Keles, S.; Keller, C.A.; Kelley, D.; Kellis, M.; Kheradpour, P.; Kim, D.S.; Kirilusha, A.; Klein, R.J.; Knoechel, B.; Kuan, S.; Kulik, M.J.; Kumar, S.; Kundaje, A.; Kutyavin, T.; Lagarde, J.; Lajoie, B.R.; Lambert, N.J.; Lazar, J.; Lee, A.Y.; Lee, D.; Lee, E.; Lee, J.W.; Lee, K.; Leslie, C.S.; Levy, S.; Li, B.; Li, H.; Li, N.; Li, X.; Li, Y.I.; Li, Y.; Li, Y.; Li, Y.; Lian, J.; Libbrecht, M.W.; Lin, S.; Lin, Y.; Liu, D.; Liu, J.; Liu, P.; Liu, T.; Liu, X.S.; Liu, Y.; Liu, Y.; Long, M.; Lou, S.; Loveland, J.; Lu, A.; Lu, Y.; Lécuyer, E.; Ma, L.; Mackiewicz, M.; Mannion, B.J.; Mannstadt, M.; Manthravadi, D.; Marinov, G.K.; Martin, F.J.; Mattei, E.; McCue, K.; McEown, M.; McVicker, G.; Meadows, S.K.; Meissner, A.; Mendenhall, E.M.; Messer, C.L.; Meuleman, W.; Meyer, C.; Miller, S.; Milton, M.G.; Mishra, T.; Moore, D.E.; Moore, H.M.; Moore, J.E.; Moore, S.H.; Moran, J.; Mortazavi, A.; Mudge, J.M.; Munshi, N.; Murad, R.; Myers, R.M.; Nandakumar, V.; Nandi, P.; Narasimha, A.M.; Narayanan, A.K.; Naughton, H.; Navarro, F.C.P.; Navas, P.; Nazarovs, J.; Nelson, J.; Neph, S.; Neri, F.J.; Nery, J.R.; Nesmith, A.R.; Newberry, J.S.; Newberry, K.M.; Ngo, V.; Nguyen, R.; Nguyen, T.B.; Nguyen, T.; Nishida, A.; Noble, W.S.; Novak, C.S.; Novoa, E.M.; Nuñez, B.; O’Donnell, C.W.; Olson, S.; Onate, K.C.; Otterman, E.; Ozadam, H.; Pagan, M.; Palden, T.; Pan, X.; Park, Y.; Partridge, E.C.; Paten, B.; Pauli-Behn, F.; Pazin, M.J.; Pei, B.; Pennacchio, L.A.; Perez, A.R.; Perry, E.H.; Pervouchine, D.D.; Phalke, N.N.; Pham, Q.; Phanstiel, D.H.; Plajzer-Frick, I.; Pratt, G.A.; Pratt, H.E.; Preissl, S.; Pritchard, J.K.; Pritykin, Y.; Purcaro, M.J.; Qin, Q.; Quinones-Valdez, G.; Rabano, I.; Radovani, E.; Raj, A.; Rajagopal, N.; Ram, O.; Ramirez, L.; Ramirez, R.N.; Rausch, D.; Raychaudhuri, S.; Raymond, J.; Razavi, R.; Reddy, T.E.; Reimonn, T.M.; Ren, B.; Reymond, A.; Reynolds, A.; Rhie, S.K.; Rinn, J.; Rivera, M.; Rivera-Mulia, J.C.; Roberts, B.; Rodriguez, J.M.; Rozowsky, J.; Ryan, R.; Rynes, E.; Salins, D.N.; Sandstrom, R.; Sasaki, T.; Sathe, S.; Savic, D.; Scavelli, A.; Scheiman, J.; Schlaffner, C.; Schloss, J.A.; Schmitges, F.W.; See, L.H.; Sethi, A.; Setty, M.; Shafer, A.; Shan, S.; Sharon, E.; Shen, Q.; Shen, Y.; Sherwood, R.I.; Shi, M.; Shin, S.; Shoresh, N.; Siebenthall, K.; Sisu, C.; Slifer, T.; Sloan, C.A.; Smith, A.; Snetkova, V.; Snyder, M.P.; Spacek, D.V.; Srinivasan, S.; Srivas, R.; Stamatoyannopoulos, G.; Stamatoyannopoulos, J.A.; Stanton, R.; Steffan, D.; Stehling-Sun, S.; Strattan, J.S.; Su, A.; Sundararaman, B.; Suner, M.-M.; Syed, T.; Szynkarek, M.; Tanaka, F.Y.; Tenen, D.; Teng, M.; Thomas, J.A.; Toffey, D.; Tress, M.L.; Trout, D.E.; Trynka, G.; Tsuji, J.; Upchurch, S.A.; Ursu, O.; Uszczynska-Ratajczak, B.; Uziel, M.C.; Valencia, A.; Biber, B.V.; van der Velde, A.G.; Van Nostrand, E.L.; Vaydylevich, Y.; Vazquez, J.; Victorsen, A.; Vielmetter, J.; Vierstra, J.; Visel, A.; Vlasova, A.; Vockley, C.M.; Volpi, S.; Vong, S.; Wang, H.; Wang, M.; Wang, Q.; Wang, R.; Wang, T.; Wang, W.; Wang, X.; Wang, Y.; Watson, N.K.; Wei, X.; Wei, Z.; Weisser, H.; Weissman, S.M.; Welch, R.; Welikson, R.E.; Weng, Z.; Westra, H.-J.; Whitaker, J.W.; White, C.; White, K.P.; Wildberg, A.; Williams, B.A.; Wine, D.; Witt, H.N.; Wold, B.; Wolf, M.; Wright, J.; Xiao, R.; Xiao, X.; Xu, J.; Xu, J.; Yan, K.-K.; Yan, Y.; Yang, H.; Yang, X.; Yang, Y.-W.; Yardımcı, G.G.; Yee, B.A.; Yeo, G.W.; Young, T.; Yu, T.; Yue, F.; Zaleski, C.; Zang, C.; Zeng, H.; Zeng, W.; Zerbino, D.R.; Zhai, J.; Zhan, L.; Zhan, Y.; Zhang, B.; Zhang, J.; Zhang, J.; Zhang, K.; Zhang, L.; Zhang, P.; Zhang, Q.; Zhang, X.-O.; Zhang, Y.; Zhang, Z.; Zhao, Y.; Zheng, Y.; Zhong, G.; Zhou, X.-Q.; Zhu, Y.; Zimmerman, J.; Snyder, M.P.; Gingeras, T.R.; Moore, J.E.; Weng, Z.; Gerstein, M.B.; Ren, B.; Hardison, R.C.; Stamatoyannopoulos, J.A.; Graveley, B.R.; Feingold, E.A.; Pazin, M.J.; Pagan, M.; Gilchrist, D.A.; Hitz, B.C.; Cherry, J.M.; Bernstein, B.E.; Mendenhall, E.M.; Zerbino, D.R.; Frankish, A.; Flicek, P.; Myers, R.M.

doi:10.1038/S41586-020-2449-8

Perspectives on ENCODE

Abascal, F.
Acosta, R.
Addleman, N.J.
Adrian, J.
Afzal, V.
Aken, B.
Akiyama, J.A.
Jammal, O.A.
Amrhein, H.
Anderson, S.M.
Andrews, G.R.
Antoshechkin, I.
Ardlie, K.G.
Armstrong, J.
Astley, M.
Banerjee, B.
Barkal, A.A.
Barnes, I.H.A.
Barozzi, I.
Barrell, D.
Barson, G.
Bates, D.
Baymuradov, U.K.
Bazile, C.
Beer, M.A.
Beik, S.
Bender, M.A.
Bennett, R.
Bouvrette, L.P.B.
Bernstein, B.E.
Berry, A.
Bhaskar, A.
Bignell, A.
Blue, S.M.
Bodine, D.M.
Boix, C.
Boley, N.
Borrman, T.
Borsari, B.
Boyle, A.P.
Brandsmeier, L.A.
Breschi, A.
Bresnick, E.H.
Brooks, J.A.
Buckley, M.
Burge, C.B.
Byron, R.
Cahill, E.
Cai, L.
Cao, L.
Carty, M.
Castanon, R.G.
Castillo, A.
Chaib, H.
Chan, E.T.
Chee, D.R.
Chee, S.
Chen, H.
Chen, H.
Chen, J.-Y.
Chen, S.
Cherry, J.M.
Chhetri, S.B.
Choudhary, J.S.
Chrast, J.
Chung, D.
Clarke, D.
Cody, N.A.L.
Coppola, C.J.
Coursen, J.
D’Ippolito, A.M.
Dalton, S.
Danyko, C.
Davidson, C.
Davila-Velderrain, J.
Davis, C.A.
Dekker, J.
Deran, A.
DeSalvo, G.
Despacio-Reyes, G.
Dewey, C.N.
Dickel, D.E.
Diegel, M.
Diekhans, M.
Dileep, V.
Ding, B.
Djebali, S.
Dobin, A.
Dominguez, D.
Donaldson, S.
Drenkow, J.
Dreszer, T.R.
Drier, Y.
Duff, M.O.
Dunn, D.
Eastman, C.
Ecker, J.R.
Edwards, M.D.
El-Ali, N.
Elhajjajy, S.I.
Elkins, K.
Emili, A.
Epstein, C.B.
Evans, R.C.
Ezkurdia, I.
Fan, K.
Farnham, P.J.
Farrell, N.
Feingold, E.A.
Ferreira, A.-M.
Fisher-Aylor, K.
Fitzgerald, S.
Flicek, P.
Foo, C.S.
Fortier, K.
Frankish, A.
Freese, P.
Fu, S.
Fu, X.-D.
Fu, Y.
Fukuda-Yuzawa, Y.
Fulciniti, M.
Funnell, A.P.W.
Gabdank, I.
Galeev, T.
Gao, M.
Giron, C.G.
Garvin, T.H.
Gelboin-Burkhart, C.A.
Georgolopoulos, G.
Gerstein, M.B.
Giardine, B.M.
Gifford, D.K.
Gilbert, D.M.
Gilchrist, D.A.
Gillespie, S.
Gingeras, T.R.
Gong, P.
Gonzalez, A.
Gonzalez, J.M.
Good, P.
Goren, A.
Gorkin, D.U.
Graveley, B.R.
Gray, M.
Greenblatt, J.F.
Griffiths, E.
Groudine, M.T.
Grubert, F.
Gu, M.
Guigó, R.
Guo, H.
Guo, Y.
Guo, Y.
Gursoy, G.
Gutierrez-Arcelus, M.
Halow, J.
Hardison, R.C.
Hardy, M.
Hariharan, M.
Harmanci, A.
Harrington, A.
Harrow, J.L.
Hashimoto, T.B.
Hasz, R.D.
Hatan, M.
Haugen, E.
Hayes, J.E.
He, P.
He, Y.
Heidari, N.
Hendrickson, D.
Heuston, E.F.
Hilton, J.A.
Hitz, B.C.
Hochman, A.
Holgren, C.
Hou, L.
Hou, S.
Hsiao, Y.-H.E.
Hsu, S.
Huang, H.
Hubbard, T.J.
Huey, J.
Hughes, T.R.
Hunt, T.
Ibarrientos, S.
Issner, R.
Iwata, M.
Izuogu, O.
Jaakkola, T.
Jameel, N.
Jansen, C.
Jiang, L.
Jiang, P.
Johnson, A.
Johnson, R.
Jungreis, I.
Kadaba, M.
Kasowski, M.
Kasparian, M.
Kato, M.
Kaul, R.
Kawli, T.
Kay, M.
Keen, J.C.
Keles, S.
Keller, C.A.
Kelley, D.
Kellis, M.
Kheradpour, P.
Kim, D.S.
Kirilusha, A.
Klein, R.J.
Knoechel, B.
Kuan, S.
Kulik, M.J.
Kumar, S.
Kundaje, A.
Kutyavin, T.
Lagarde, J.
Lajoie, B.R.
Lambert, N.J.
Lazar, J.
Lee, A.Y.
Lee, D.
Lee, E.
Lee, J.W.
Lee, K.
Leslie, C.S.
Levy, S.
Li, B.
Li, H.
Li, N.
Li, X.
Li, Y.I.
Li, Y.
Li, Y.
Li, Y.
Lian, J.
Libbrecht, M.W.
Lin, S.
Lin, Y.
Liu, D.
Liu, J.
Liu, P.
Liu, T.
Liu, X.S.
Liu, Y.
Liu, Y.
Long, M.
Lou, S.
Loveland, J.
Lu, A.
Lu, Y.
Lécuyer, E.
Ma, L.
Mackiewicz, M.
Mannion, B.J.
Mannstadt, M.
Manthravadi, D.
Marinov, G.K.
Martin, F.J.
Mattei, E.
McCue, K.
McEown, M.
McVicker, G.
Meadows, S.K.
Meissner, A.
Mendenhall, E.M.
Messer, C.L.
Meuleman, W.
Meyer, C.
Miller, S.
Milton, M.G.
Mishra, T.
Moore, D.E.
Moore, H.M.
Moore, J.E.
Moore, S.H.
Moran, J.
Mortazavi, A.
Mudge, J.M.
Munshi, N.
Murad, R.
Myers, R.M.
Nandakumar, V.
Nandi, P.
Narasimha, A.M.
Narayanan, A.K.
Naughton, H.
Navarro, F.C.P.
Navas, P.
Nazarovs, J.
Nelson, J.
Neph, S.
Neri, F.J.
Nery, J.R.
Nesmith, A.R.
Newberry, J.S.
Newberry, K.M.
Ngo, V.
Nguyen, R.
Nguyen, T.B.
Nguyen, T.
Nishida, A.
Noble, W.S.
Novak, C.S.
Novoa, E.M.
Nuñez, B.
O’Donnell, C.W.
Olson, S.
Onate, K.C.
Otterman, E.
Ozadam, H.
Pagan, M.
Palden, T.
Pan, X.
Park, Y.
Partridge, E.C.
Paten, B.
Pauli-Behn, F.
Pazin, M.J.
Pei, B.
Pennacchio, L.A.
Perez, A.R.
Perry, E.H.
Pervouchine, D.D.
Phalke, N.N.
Pham, Q.
Phanstiel, D.H.
Plajzer-Frick, I.
Pratt, G.A.
Pratt, H.E.
Preissl, S.
Pritchard, J.K.
Pritykin, Y.
Purcaro, M.J.
Qin, Q.
Quinones-Valdez, G.
Rabano, I.
Radovani, E.
Raj, A.
Rajagopal, N.
Ram, O.
Ramirez, L.
Ramirez, R.N.
Rausch, D.
Raychaudhuri, S.
Raymond, J.
Razavi, R.
Reddy, T.E.
Reimonn, T.M.
Ren, B.
Reymond, A.
Reynolds, A.
Rhie, S.K.
Rinn, J.
Rivera, M.
Rivera-Mulia, J.C.
Roberts, B.
Rodriguez, J.M.
Rozowsky, J.
Ryan, R.
Rynes, E.
Salins, D.N.
Sandstrom, R.
Sasaki, T.
Sathe, S.
Savic, D.
Scavelli, A.
Scheiman, J.
Schlaffner, C.
Schloss, J.A.
Schmitges, F.W.
See, L.H.
Sethi, A.
Setty, M.
Shafer, A.
Shan, S.
Sharon, E.
Shen, Q.
Shen, Y.
Sherwood, R.I.
Shi, M.
Shin, S.
Shoresh, N.
Siebenthall, K.
Sisu, C.
Slifer, T.
Sloan, C.A.
Smith, A.
Snetkova, V.
Snyder, M.P.
Spacek, D.V.
Srinivasan, S.
Srivas, R.
Stamatoyannopoulos, G.
Stamatoyannopoulos, J.A.
Stanton, R.
Steffan, D.
Stehling-Sun, S.
Strattan, J.S.
Su, A.
Sundararaman, B.
Suner, M.-M.
Syed, T.
Szynkarek, M.
Tanaka, F.Y.
Tenen, D.
Teng, M.
Thomas, J.A.
Toffey, D.
Tress, M.L.
Trout, D.E.
Trynka, G.
Tsuji, J.
Upchurch, S.A.
Ursu, O.
Uszczynska-Ratajczak, B.
Uziel, M.C.
Valencia, A.
Biber, B.V.
van der Velde, A.G.
Van Nostrand, E.L.
Vaydylevich, Y.
Vazquez, J.
Victorsen, A.
Vielmetter, J.
Vierstra, J.
Visel, A.
Vlasova, A.
Vockley, C.M.
Volpi, S.
Vong, S.
Wang, H.
Wang, M.
Wang, Q.
Wang, R.
Wang, T.
Wang, W.
Wang, X.
Wang, Y.
Watson, N.K.
Wei, X.
Wei, Z.
Weisser, H.
Weissman, S.M.
Welch, R.
Welikson, R.E.
Weng, Z.
Westra, H.-J.
Whitaker, J.W.
White, C.
White, K.P.
Wildberg, A.
Williams, B.A.
Wine, D.
Witt, H.N.
Wold, B.
Wolf, M.
Wright, J.
Xiao, R.
Xiao, X.
Xu, J.
Xu, J.
Yan, K.-K.
Yan, Y.
Yang, H.
Yang, X.
Yang, Y.-W.
Yardımcı, G.G.
Yee, B.A.
Yeo, G.W.
Young, T.
Yu, T.
Yue, F.
Zaleski, C.
Zang, C.
Zeng, H.
Zeng, W.
Zerbino, D.R.
Zhai, J.
Zhan, L.
Zhan, Y.
Zhang, B.
Zhang, J.
Zhang, J.
Zhang, K.
Zhang, L.
Zhang, P.
Zhang, Q.
Zhang, X.-O.
Zhang, Y.
Zhang, Z.
Zhao, Y.
Zheng, Y.
Zhong, G.
Zhou, X.-Q.
Zhu, Y.
Zimmerman, J.
Snyder, M.P.
Gingeras, T.R.
Moore, J.E.
Weng, Z.
Gerstein, M.B.
Ren, B.
Hardison, R.C.
Stamatoyannopoulos, J.A.
Graveley, B.R.
Feingold, E.A.
Pazin, M.J.
Pagan, M.
Gilchrist, D.A.
Hitz, B.C.
Cherry, J.M.
Bernstein, B.E.
Mendenhall, E.M.
Zerbino, D.R.
Frankish, A.
Flicek, P.
Myers, R.M.
Mostra tots els autors/es +

Revista:

Nature

ISSN: 1476-4687, 0028-0836

Any de publicació: 2020

Volum: 583

Número: 7818

Pàgines: 693-698

Tipus: Revisió

DOI: 10.1038/S41586-020-2449-8 GOOGLE SCHOLAR Accés obert editor