Retos del empleo de la secuenciación masiva de nueva generación (NGS) de la macrofauna bentónica para la evaluación de la calidad ambiental marina

  1. Gerardo J. Martí-Chillón 1
  2. Ana de Luis 1
  3. Mónica Díez-Díaz 1
  4. Javier Torres Gavilá 1
  5. José Rafael García-March 1
  6. José Tena Medialdea 1
  7. Francisco M. Codoñer 1
  1. 1 Universidad Católica de Valencia San Vicente Mártir
    info

    Universidad Católica de Valencia San Vicente Mártir

    Valencia, España

    ROR https://ror.org/03d7a9c68

Revue:
Nereis: revista iberoamericana interdisciplinar de métodos, modelización y simulación

ISSN: 1888-8550

Année de publication: 2017

Número: 9

Pages: 81-90

Type: Article

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Résumé

La Directiva Marco del Agua 2000/60/CE obliga al diagnóstico ambiental del ecosistema marino, incluyendo la evaluación de las especies de macroinvertebrados considerados bioindicadores presentes en el medio. Hasta la fecha, este tipo de determinaciones se realizan mediante la identificación taxonómica de visu de la macrofauna bentónica presente en las muestras y el cálculo de bioíndices asociados, un proceso costoso en términos de tiempo y financiación y, en algunos casos, subjetivo por precisar de un equipo humano altamente especializado y por la dificultad de identificar correctamente determinadas especies. En este sentido, las técnicas de DNA barcoding permiten identificar de forma fiable organismos empleando técnicas de secuenciación de DNA y evitando las desventajas de la identificación morfotaxonómica. Por otro lado, el reciente desarrollo de técnicas de secuenciación masiva de DNA de nueva generación (NGS) ha permitido el desarrollo del DNA metabarcoding, o caracterización de poblaciones de organismos presentes en una muestra empleando datos genómicos. Este trabajo plantea los retos fundamentales que presenta, a día de hoy, el análisis de organismos bioindicadores de calidad ambiental marina a través de las técnicas de secuenciación NGS.

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